我国一些常见的头癣致病菌菌种随着时间推移发生着变迁。20世纪80年代前期,许兰毛癣菌和铁锈色小孢子菌是主要致病菌;80年代后期,须癣毛癣菌和紫色毛癣菌为主要致病菌。
20世纪90年代末至今,大部分地区最常见的致病菌为犬小孢子菌和须癣毛癣菌,这与饲养宠物密切相关。
新疆维吾尔自治区因其独特的地理和气候条件,头癣的主要致病菌多为紫色毛癣菌、许兰毛癣菌和铁锈色小孢子菌。